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Compute Canada Fall Update


Table of contents  

Why Investing in ARC resources is essential to competitive science and innovation in Canada

 

                 


Mark Dietrich, President and CEO of Compute Canada makes the case in his recent blog post for further investment in a federated, national ARC system. Recent analysis of the “Top 500” list (top500.org) of top supercomputing resources, compared to statistics on the number of researchers in major countries, shows that, in terms of resources per researcher, Canada has dropped from a ranking of 6th to 24th in the world over the past 6 years. But what does this mean for the Canadian research community, and indeed, all Canadians who benefit from scientific innovation?

Read more.  



 

Supercomputing: Innovation’s Infrastructure Event on the Hill

On October 17, 2016 Senator Ogilvie and Compute Canada co-hosted an event for parliamentarians to raise awareness of the essential role supercomputing plays in Canada's discovery and innovation communities. Read more

Meet the world-class Canadian innovators and researchers that are using Compute Canada’s advanced research computing (ARC) systems to accelerate scientific discovery in everything from harnessing the power of genomics to revolutionizing manufacturing. Read more.

Compute Canada’s Women in HPC (WomenHPC) initiative creates opportunities for early career women and researchers in high performance computing

 
Over 50 participants from across Canada came together for an event in Ottawa celebrating the role of women in high performance computing (HPC). Hosted by Compute Canada, the Women in HPC (WHPC) outreach event featured keynote Dr. Peg Williams (Senior Vice President, Research and Development, of Cray) and Carol Hopkins (Senior Director Supercomputing, Shared Services Canada) acted as the moderator of lightning talks from inspirational women working in HPC. This event brought together people from all stages of their careers and from all sectors, including corporate organizations, research institutions, and academia. Read more.

Multi-Million Dollar Investment in National Big Data Storage Solutions

On August 24, 2016 Compute Canada in partnership with its member institutions announced the results of a multi-million dollar investment in a national big data storage solutions for Canada’s growing community of advanced computing researchers. Four new national advanced computing sites will be deployed at the University of Victoria, Simon Fraser University, the University of Waterloo and the University of Toronto over the next 18 months. Read more.

Cloud Capacity Increased, as a result of Cyberinfrastructure Investment

On September 8, Compute Canada Cloud Services were augmented by over 6,000 CPU cores, as a result of the GP1 procurement at the University of Victoria. Read more.
 

Compute Canada Launches Resource Allocation Competitions for 2017

On October 11, Compute Canada launched its annual Resource Allocation Competitions (RAC), a peer-reviewed process to grant priority access to Compute Canada’s advanced research computing resources. RAC has become increasingly popular, resulting in increased pressure on available resources. Last year, 54% of the requested resources were awarded.

What you need to know about the current capacity available to our research community...Read More.
 

Research Profile - Genomicist Tiffany Timbers

Timbers is a Banting post-doctoral fellow at Simon Fraser University whose work on nematodes (roundworms) and other invertebrates can have significant effects on interpreting and understanding genetic mutations in humans, particularly the ones that cause disease. Read more.

 

Human Dimensions Open Data Challenge Winners Announced

Compute Canada and its partners are pleased to announce the two winning teams of the Human Dimensions Open Data Challenge: the winning team from University of Ottawa was led by Dr. Patrick McCurdy and Dr. Rafat Alam led a research team at Grant MacEwan University to second place. Read more.
 

Annual Report 2015-2016

Compute Canada’s Annual Report 2015-2016 “Supercomputing: Innovation’s Infrastructure” is now available. Compute Canada is championing the largest renewal of advanced research computing resources in Canada’s history with the goals of:

  • supporting the needs of Canada’s globally competitive research community

  • enabling big Canadian science investments; and,

  • Helping to attract and retain world-class researchers at institutions across Canada. Read more.
 

News from the Regions



ACENET continues to broaden its representation of post-secondary institutions in Atlantic Canada, providing access to advanced computing resources and training for researchers in increasingly diverse research areas. We are pleased to welcome the New Brunswick Community College, Nova Scotia Community College, the Nova Scotia College of Art & Design University, and Mount St. Vincent University to our membership.

Researcher Recognized by ACFAS

The Association francophone pour le savoir (Acfas) has recently presented its annual awards. Anne Bruneau, professor of the Department of Biological Sciences at the Université de Montréal and member of Calcul Québec, won the Michel-Jurdant award for her research in environmental science and her contribution to knowledge and the preservation of biodiversity. Ms. Bruneau and her research team use Calcul Québec resources to study the phylogenetics and taxonomy of leguminous plants. She is also the director of the Institut de recherche en biologie végétale and founder and scientific director of the University of Montreal Biodiversity Centre. This centre facilitates international networking and data accessibility for the large biological database of Canadensys. Congratulations!


 

Join us at the 2017 High Performance Computing Symposium in beautiful Kingston, Ontario, from June 5-9 at Queen’s University. HPCS is Canada's premier Advanced Research Computing (ARC) conference, bringing together top researchers from across Canada and around the world, as well as major industry partners.

This year’s conference will include a range of keynote sessions and technical workshops designed to appeal to the research community and ARC professionals.  Topics will include “traditional” HPC disciplines, as well as emerging areas such as cognitive computing – we’ll also have sessions exploring future technologies.

You’ll also have the opportunity to explore the stunning and historic City of Kingston – Canada’s first capital.  With 2017 being Canada’s 150th anniversary it’s sure to be special.  You’ll get to enjoy Old Fort Henry, a UNESCO Heritage Site, as well as tour the 1000 Islands aboard a Discovery Cruise.

Please join us in Kingston for what we know will be a memorable HPCS!

Using ARC in Genomics & Bioinformatics

WestGrid has partnered with the Advanced Research Computing (ARC) Team at the University of British Columbia and experts at Canada’s Michael Smith Genome Sciences Centre to deliver a series of hands-on training webinars for researchers in medical and health sciences fields. The sessions will be delivered online with interactive exercises and demonstrations, and will showcase some of the ARC services and tools available to support bioinformatics and genomics research.

NOV 15: Introduction to the Genome Sciences Centre

NOV 23: Introduction to Next Generation Sequencing Analysis Part I: Short-read Mapping and Visualization

DEC 15: A Hands-on Introduction to ORCA (the genOmics Research Container Architecture)


For more information on these sessions, visit the WestGrid website.

Bulletin d’information Calcul Canada



Table des matières

 

 

 Pourquoi l'investissement dans les ressources de CIP est-il essentiel à la science et à l'innovation compétitive au Canada.    

 
               

 

Mark Dietrich, président et chef de la direction de Calcul Canada, en expose les raisons dans son récent billet de blogue au sujet de futurs investissements dans un système national et fédéré de CIP. Une analyse récente de la liste des 500 meilleures (top500.org) ressources en superinformatique en parallèle avec les statistiques sur le nombre de chercheurs dans les grands pays montre que le Canada est passé du 6e au 24e rang dans le monde au cours des six dernières années pour le rapport des ressources par chercheur. Que signifie cette baisse pour le milieu de la recherche au Canada et, en fait, pour tous les Canadiens qui à qui profitent ces innovations scientifiques? Lire la suite…

 

Superordinateurs : un évènement sur la Colline présente l'infrastructure d'innovation

Le 17 octobre 2016, le sénateur Ogilvie et Calcul Canada accueillaient les parlementaires pour faire mieux connaitre le rôle essentiel que jouent les superordinateurs dans les milieux de la découverte et de l'innovation au Canada. Lire la suite...

Découvrez les innovateurs et les chercheurs canadiens de calibre international qui utilisent les systèmes de CIP de Calcul Canada pour accélérer leurs découvertes scientifiques dans tous les domaines, de l'exploitation de la puissance de la génomique à la révolution du monde manufacturier. Lire la suite...


 

L'initiative Women in HPC (WomenHPC) de Calcul Canada ouvre des perspectives d'avenir aux femmes en début de carrière et aux chercheuses en calcul de haute performance

Plus de 50 participants de tout le Canada se sont rassemblés pour un évènement à Ottawa visant à souligner le rôle des femmes en calcul de haute performance (CHP). Parrainé par Calcul Canada, l'évènement de rayonnement du réseau Women in HPC (WHPC) proposait une présentation de madame Peg Williams (vice-présidente directrice de la recherche et du développement chez Cray) ainsi que des présentations éclair de femmes inspirantes travaillant dans le CHP, animées par Carol Hopkins (directrice principale de Services partagés Canada).

Cet évènement a réuni des gens à différentes étapes de leur cheminement de carrière, provenant de tous les secteurs, de grandes entreprises, des établissements de recherche et du milieu universitaire. Lire la suite...

 

Investissement de plusieurs millions de dollars dans une solution nationale de stockage de mégadonnées  

Par suite de l’obtention de financement totalisant plusieurs millions de dollars, Calcul Canada, en partenariat avec ses établissements membres, a annoncé le 24 aout 2016 la mise en œuvre de sa solution nationale de stockage de mégadonnées destinée à la communauté croissante de chercheurs en calcul informatique de pointe. Quatre nouveaux sites de CIP seront déployés au Canada au cours des 18 prochains mois, soit à l’Université de Victoria, à l’Université Simon-Fraser, à l’Université de Waterloo et à l’Université de Toronto. Lisez davantage.

Augmentation de la capacité infonuagique grâce à l'investissement dans la cyberinfrastructure

Le 8 septembre dernier, plus de 6 000 cœurs de processeur ont été ajoutés aux services infonuagiques de Calcul Canada dans le cadre de l’acquisition du système GP1 à l’Université de Victoria. Lisez davantage.
 

Calcul Canada lance son concours d'allocation des ressources pour 2017

Le 11 octobre, Compute Canada a lancé son concours d'allocation des ressources (CAR), un processus évalué par les pairs pour accorder des priorités d'accès aux ressources de calcul informatique de pointe de Calcul Canada. Le CAR est de plus en plus populaire, ce qui augmente la pression sur les ressources disponibles. Cette année, on estime qu'environ 54 % des ressources demandées seront attribuées.

Ce que vous avez besoin de savoir sur la capacité actuellement disponible pour notre communauté scientifique… En apprendre plus.
 
Portrait de chercheuse – La génomicienne Tiffany Timbers
Tiffany Timbers est titulaire d’une bourse postdoctorale Banting à l’Université Simon-Fraser. Son travail sur les nématodes (vers ronds) et les autres invertébrés peut avoir une incidence importante sur l’interprétation et la compréhension des mutations génétiques chez les humains, particulièrement celles qui causent des maladies. Lisez davantage.

Annonce des gagnants du Défi données ouvertes sur les dimensions humaines

Calcul Canada et ses partenaires sont heureux d’annoncer le nom des deux équipes gagnantes du Défi données ouvertes sur les dimensions humaines : l’équipe de recherche de l’Université d’Ottawa dirigée par le Patrick McCurdy a remporté le premier prix  et l’équipe de recherche de l’Université Grant MacEwan dirigée par le Rafat Alam est arrivée deuxième. Lisez davantage..

Rapport annuel 2015-2016

Le rapport annuel 2015-2016 de Calcul Canada : « La superinformatique : une infrastructure d’innovation » est maintenant accessible. Calcul Canada dirige le plus important renouvèlement de la plateforme nationale de calcul informatique de pointe en recherche ayant comme objectifs de :

  • répondre aux besoins des chercheurs canadiens qui souhaitent demeurer compétitifs au plan international;

  • faciliter les investissements scientifiques canadiens à grande échelle;  

  • aider à attirer et à retenir des chercheurs de calibre international au sein des institutions canadiennes d’un océan à l’autre. Lisez davantage.

Vitrine des régions


ACENET continue d’étoffer ses représentants dans les institutions postsecondaires dans les provinces atlantiques, permettant ainsi l’accès aux ressources informatiques avancées et à la formation pour les chercheurs dans un champ croissant de recherche. Nous avons le plaisir d’accueillir le Nouveau-Brunswick Community College (NBCC), le Nova Scotia Community College, l’Université de l’École d’Art & Design de la Nouvelle-Écosse et l’Université Mount St Vincent parmi nos nouveaux membres.


 

 Une de nos chercheuses récompensées par l’ACFAS

L’Association francophone pour le savoir — Acfas remettait récemment ses prix annuels. Anne Bruneau, professeur du département de biologie de l’Université de Montréal et membre de Calcul Québec, s’est vue remettre le prix Michel-Jurdant qui récompense ses travaux en sciences de l’environnement ainsi que sa contribution à la connaissance et la préservation de la biodiversité. Madame Bruneau et son équipe de recherche utilisent les ressources de Calcul Québec pour étudier la phylogénétique et la taxonomie des légumineuses. Elle dirige également l’Institut de recherche en biologie végétale, et assure la direction scientifique du Centre sur la biodiversité de l’Université de Montréal, dont elle est la fondatrice. Ce centre a entre autres comme mission de coordonner la mise en réseau et l’accessibilité internationale des données des grandes collections biologiques de Canadensys. Toutes nos félicitations!


Du 5 au 9 juin, joignez-vous à nous au Symposium 2017 High Performance Computing à l’Université Queen’s, dans la belle ville de Kingston, en Ontario. L’HPCS est la première conférence donnée sur le Calcul informatique de pointe (CIP) au Canada, rassemblant en un même lieu les meilleurs chercheurs canadiens et du monde entier avec nos principaux partenaires du secteur.

Cette année, la conférence comprendra une série d’exposés à thème, des ateliers de travaux techniques conçus pour encenser la communauté de chercheurs et les professionnels du CIP. Les domaines HPC figureront parmi les thèmes « traditionaux », tandis que seront révélées les sciences émergentes, telles que l’informatique cognitive. Plusieurs séances exploreront les nouvelles technologies.

Vous aurez aussi l’occasion d’explorer la surprenante et historique ville de Kingston. 2017 étant l’année du 150e anniversaire du Canada, une visite dans la première capitale du pays sera surement quelque chose de spécial. Vous aurez ainsi l’occasion de voir Fort Henri, classée au patrimoine mondial de l’UNESCO. Et pourquoi ne pas faire une croisière découverte autour des 1000 iles?

Venez nous rejoindre à Kingston pour ce qui sera un HPCS rempli de souvenirs!

 


Utiliser le CIP en génome et en bio-informatique

WestGrid s’est associé à l’équipe de calcul informatique de pointe (CIP) de l’Université de Colombie-Britannique et à des experts au Centre d’étude des sciences génomiques Michael Smith du Canada pour offrir une série de formations webinaires pratiques dans le but d’appuyer les chercheurs en médecine et en science de la santé. Les séances seront offertes en ligne et se composeront d’exercices, de démonstrations et exemplifieront quelques services et outils à disposition sur le CIP pour soutenir la recherche en bio-informatique et en génomique.

15 NOV. : Introduction to the Genome Sciences Centre

23 NOV. : Introduction to Next Generation Sequencing Analysis Part I: Short-read Mapping and Visualization

15 DEC. : A Hands-on Introduction to ORCA (the genOmics Research Container Architecture)

Pour plus d’information sur les séances, visitez le site web de WestGrid.

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